克罗恩病病人主要的临床症状是腹痛腹泻，严重的病人可能会出现一些消化道的梗阻、穿孔、脓肿、肛瘘，甚至癌变，还有病人时间长了，狭窄以后引起的一些吸收功能障碍以后造成营养不良，对于儿童和青少年会影响他的生长和发育，克罗恩病人还有很多病人有肠外表现，或者很多是以肠外表现来看病，影响他的生活起居，包括皮肤的一些脓疱病，眼睛的虹膜炎，还有一些比如说肝胆的疾病，还有造成血栓。