克罗恩疾病的发病原因，到目前为止并不是很清楚的，但是通过临床观察，发现诱发克罗恩疾病加重的因素有几个方面。第一个，比如细菌感染或者病毒感染。其次，克罗恩疾病的发病和加重跟饮食结构有关，比如高脂肪、高蛋白、低纤维的饮食的摄入。克罗恩疾病的发生，跟肠道菌群失调也有密切的关系。再其次克罗恩疾病可能跟免疫系统有关系。克罗恩疾病的发生，可能跟遗传因素有一定关系。这些都是引起克罗恩疾病发生或加重的一些原因。