头部CT和核磁共振不能替代脑电图。脑电图检查进入脑组织的电活动，得到的检测结果是脑电波图形，但它不能反应脑的结构。例如，在脑电图上显示左颞叶的慢波，它可以是陈旧性的脑外伤、颞叶外伤的结果，也可能颞叶有个肿瘤导致的结果，很明显这两种疾病的治疗办法是截然不同的。陈旧性的外伤可以观察，而脑肿瘤却需要外科治疗。为了查明引起异常的脑电图的原因，需要患者去完善脑部结构的检查，而核磁共振和CT是可以了解脑内结构性的病变，但是脑电图检测和核磁共振结合起来却有助于癫痫病灶的定位。比如脑电图放电部位假如提示在内颞叶，而核磁共振和CT检查提示有海马硬化，它们两个结合起来考虑，有可能可是海马硬化引起内颞叶的癫痫。