在清华，自动化系与电子、软件、计算机一样，隶属于信息学院，只有一个自动化专业。

如果你要问的是研究方向或者实验室的话，有检测电子研究所、CIMS（计算机集成制造系统）研究所，控制理论研究所，信息所等等（记不清全名，但名字也都是差不多），其中比较好的有控制理论研究所跟信息所，我就是CIMS的。

PS:如果还有疑问请追加问题。