《终极一班2》是《终极一班》的续集，讲述了汪大东（汪东城饰）在护送刘备回银时空的过程中，由于时空共振的影响，与刘备一同失踪，并在十年后醒来发现自己躺在女子更衣室的椅子上。在这段时间里，金时空的战力指数和KO榜神秘消失。大东回到终极一班后，发现一切似乎都与芭乐高中有关，而所有的秘密都隐藏在芭乐高中。

在终极一班，大东遇到了校工断肠人（那维勋饰），从他那里得知，终极一班的老大雷婷（曾沛慈饰）在大东失踪的八年中成为了终极一班的领袖，被称为“The King”，即史上最强的王。大东在寻找父母和兄弟的过程中，与雷婷发生了冲突，但最终两人和解。

此外，大东还遇到了金宝三（张皓明饰），他自称是KO榜上排名KO.8的高手，但在大东出现后被打成内伤，变成KO.135。金宝三告诉大东，他已经消失了十年，而在这段时间里，父母、亚瑟和小雨为了寻找大东也下落不明。

在剧情的发展中，大东逐渐适应了新的终极一班，并与雷婷建立了深厚的友谊。他们一起面对了各种挑战，包括战力指数和KO榜的消失之谜，以及隐藏在芭乐高中深处的秘密。