1、教义不同：逊尼派是在不同的教派、学派、教法学派长期斗争中形成的一个具有自身化传统的教派。而什叶派将信伊马目作为基本信条之一，由于在伊马目的数目和人选上存在分歧，什叶派又分为不同支派。
2、地位不同：逊尼派为历代伊斯兰国家中央政权所奉行，先后被倭马亚王朝、后朝斯王朝、塞尔柱王朝等定为国教，得到官植而广泛流传，故称“正统派”。由于历史根源，什叶派则尊崇于阿里派及其子孙后代。
3、派别不同：从法源角度来看，逊尼派公认四个法律源泉，即《古兰经》、圣训、公议和类比推理，而对什叶派来说，教法的根源只有三个，即《古兰经》、圣训和伊玛目的教法判决。