自 12 月 1 日在加利福尼亚州首次发现 COVID-19 omicron 变体以来，美国近一半的州都有报道。该国第二例已知的 omicron 病例是在明尼苏达州发现的。

“检测到 omicron 的人——州、县、国家——并不一定意味着他们是第一个拥有它的人，”Mayo Clinic 临床微生物学部主任 Bobbi Pritt 博士说。“只是他们是最早检测到它的州之一。在明尼苏达州，我们是最早检测到 omicron变体存在的州之一。那是因为我们对大量 COVID-19 阳性样本进行了测序。我们有一个非常好的测序系统。”

梅奥诊所实验室一直在与明尼苏达州卫生官员和其他学术医疗中心合作，通过分析病毒的遗传密码寻找新的变种。

为了帮助更好地理解基因组测序及其工作原理，Pritt 博士在此问答中进行了解答。

跟踪变异或对基因组进行测序意味着什么?

当我们谈到识别变种或追踪病毒变种时，通常指的是分析病毒的遗传密码，看看它是否是一种变种，以及它是哪种变种。

你能解释一下分子测序过程吗?

首先，你必须从阳性样本开始。你有一份包含 SARS-CoV-2(导致 COVID-19 的病毒)的患者样本，然后你取出那个阳性样本，对其进行一种叫做提取的处理，提取病毒的遗传密码，并对其进行纯化，以及所有人类 DNA 和 RNA。

然后对其进行 PCR(聚合酶链反应)。就我们在​​梅奥诊所使用的测试而言，PCR 是一种测试，可以放大整个病毒的一小部分或几乎整个病毒的遗传密码，以产生数百万个拷贝。然后需要对所有已扩增的小片段进行测序。

接下来，逐个字母地创建遗传密码。并将该代码与公开可用的序列库进行比较，以便您可以查看它是否与已知变体之一相匹配，或者它是否可能是全新的。

这是下一代测序——通过以大规模并行方式产生数百万个序列读数来对 DNA 或 RNA 进行测序的过程。下一代测序也称为深度测序，可以对微生物的整个基因组进行测序。