这变法与反变法斗争的严重时刻，吕惠卿以一位改革家的大无畏精神，坚定地同其他变法派一起力挽狂澜。

他一方面同司马光进行面对面所剧烈廷辩，针对司马光诬蔑县官靠法令威逼室借青苗钱一事，进行义正词严的驳斥，一针见血地指出此事富室为之害民，县官为之利民。

青苗钱民愿取者给予，不愿取者不强借。

一“ 害”，一“利”，旗帜鲜明，言辞锋利，态度坚决，刺中司马光的要害。

另一方面 ，吕惠卿又发动监司，郡守向神宗这利害关系，还“从容白帝（神宗）下诏，言终不以史违法之故，为之废法”。

与此同时，他还虑及一旦王安石离职，必定招致新法动摇的严重恶果，所以用各种办法上书神宗挽留王安石。

由于吕惠卿等变法派的坚决斗争，促进了神宗迅速改变态度。

几天后，神宗召见王安石说：青苗法，朕诚为众论所惑，寒食假中，静思此事，一无所害。

神宗的转变，使王安石继续执政， 新法继续坚定地推行，变法派取得了第一个回合的重大胜利。

这个胜利的取得，吕惠卿起了很大的重大的作用，这一点王安石曾给予充分肯定，他说：“法之初行，议论纷纷，独惠卿与布（曾布）终始不易，余人则一出焉一入焉尔！”。