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新冠疫苗第二针赶上生理期能继续打，月经期不是接种新冠疫苗的禁忌证。根据目前最新的新型冠状病毒接种指引中指出，月经期不是接种新冠病毒疫苗的禁忌证，因此在生理期的时候，如果遇到接种新冠疫苗的第二针，原则是可以接种的。但是考虑到部分妇女在生理期的时候，可能会出现痛经、全身疲乏无力等表现，并且由于第二针疫苗可以在第一针后的3到8周内接种，可以考虑在第二针接种的时间内适当延迟，避免在生理期接种。对于生理期等特殊时期，在接种疫苗之前需要向在场的医护人员说明既往病史以及过敏史，注射完疫苗后建议在现场留观，注意观察有无不良反应的发生。