《星际防御战》的故事发生在光元9-2年，西怒已经统治了整个银河系，但是仍然有部分追求自由的人类逃脱了西怒的势力范围，携带了大量能量水晶并在银河系某处边缘附近建立起了一个个小型太空基地，成立了反叛军团。但是实际上这一切已经被西怒知晓，并派出了自己手中的精锐力量——黑武士军团，试图抢走能量水晶，消灭人类这最后的希望。黑武士们成功的闯入了太空基地，却遭遇了基地中防守炮塔猛烈攻击，一场争夺基地能量水晶的战斗就此展开。