抗生素对菌群的影响因人而异
抗生素治疗会破坏人体肠道中有益和有害细菌的平衡。这种破坏会导致肠道菌群中真菌物种的过度生长,包括常见的肠道酵母白色念珠菌。然而,研究人员对潜在机制的了解有限。
本周在mBio上,欧洲的研究人员在首次对人类受试者进行此类研究时报告了使用常见的 β-内酰胺抗生素治疗如何导致患者白色念珠菌发生显着变化。值得注意的是,他们发现并非所有患者的反应都相同,白色念珠菌数量增加的程度在很大程度上取决于个体的微生物群。这种差异表明,白色念珠菌过度生长的风险对抗生素治疗的反应对每个人来说都不一样。
“这项研究表明,情况比以前想象的要复杂,并且使用某些抗生素,如 β-内酰胺,白色念珠菌的增加因人而异,”微生物学家和资深作者 Marie-Elisabeth Bougnoux 医学博士说,法国巴黎巴斯德研究所博士。
长期以来,研究人员一直在研究抗生素对肠道菌群的影响,但很少有人关注菌群或肠道真菌物种的集合。新研究的作者指出了两个原因。
“首先,很难用宏基因组学技术研究菌群,”博士 Margot Delavy 说。该研究所的学生和该论文的第一作者,“其次,真菌的浓度远低于细菌的浓度”,这使得它们更难测量。“研究肠道真菌的可重复宏基因组技术最近才出现,”她说。
在这项新研究中,Bougnoux 和她的同事使用粪便样本追踪 2 组 11 名健康患者在接受头孢噻肟(一组)或头孢曲松(另一组)治疗之前、期间和之后肠道菌群的变化. 两种药物均为第三代头孢类抗生素。
该小组首先确定了与真菌种类相关的粪便 DNA 部分。然后,他们使用高通量测序来确定在接受抗生素治疗之前,志愿者的健康肠道中存在哪些真菌种类。他们发现,物种的多样性和丰度不仅因人而异,而且在同一个体的不同种群之间也存在差异。该团队使用特定的 qPCR 来量化白色念珠菌的水平,并在 95% 的参与者中发现了这种真菌。
研究人员在抗生素治疗期间和之后进行了类似的分析。他们发现,在接受抗生素治疗后,所有患者的真菌负荷——粪便 DNA 的比例——全面增加。但在物种层面,这些反应差异很大。一些人的白色念珠菌和其他物种的丰度显着增加,而其他人则没有。(至少有一位参与者甚至表现出下降。)
对样本的进一步分析表明,真菌对抗生素治疗的反应变化与β-内酰胺酶的活性有关,这种酶是由受试者微生物群中的内源性细菌产生的。与酶水平较高的人相比,β-内酰胺酶水平较低的人经历了更多的真菌生长,包括白色念珠菌。
Bougnoux 之前的工作重点是肠道白色念珠菌定植如何导致感染,他说该小组希望关注抗生素的使用,因为它是定植的主要风险因素。她指出,这项新研究是朝着理解真菌群如何对治疗作出反应迈出的有希望的第一步——但这仅仅是个开始。
“我们的研究是针对仅接受一种抗生素的人类志愿者进行的,但实际患者通常会接受多种抗生素,”布格努克斯说。她补充说,那些接受最多的人最有可能患上真菌感染。“我们发现的 β-内酰胺与肠道白色念珠菌定植减少之间的关系在这些患者中是否也属实还有待观察。”